Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppfibp1Q8C8U0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms