Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Usp20Q8C6M1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Usp20Q8C6M1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Usp20Q8C6M1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Usp20Q8C6M1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Usp20Q8C6M1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Usp20Q8C6M1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Usp20Q8C6M1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Usp20Q8C6M1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Usp20Q8C6M1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Usp20Q8C6M1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Usp20Q8C6M1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Usp20Q8C6M1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp20Q8C6M1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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