Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Ccdc113Q8C5T8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Ccdc113Q8C5T8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Ccdc113Q8C5T8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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Ccdc113Q8C5T8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc113Q8C5T8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Ccdc113Q8C5T8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc113Q8C5T8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc113Q8C5T8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Ccdc113Q8C5T8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Ccdc113Q8C5T8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc113Q8C5T8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Ccdc113Q8C5T8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Ccdc113Q8C5T8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc113Q8C5T8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Ccdc113Q8C5T8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc113Q8C5T8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Ccdc113Q8C5T8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc113Q8C5T8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc113Q8C5T8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc113Q8C5T8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc113Q8C5T8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc113Q8C5T8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Ccdc113Q8C5T8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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