Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Cwc22Q8C5N3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cwc22Q8C5N3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms