Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdac7Q8C2B3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdac7Q8C2B3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdac7Q8C2B3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdac7Q8C2B3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdac7Q8C2B3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdac7Q8C2B3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdac7Q8C2B3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdac7Q8C2B3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdac7Q8C2B3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdac7Q8C2B3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdac7Q8C2B3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdac7Q8C2B3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdac7Q8C2B3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdac7Q8C2B3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdac7Q8C2B3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdac7Q8C2B3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdac7Q8C2B3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdac7Q8C2B3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdac7Q8C2B3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdac7Q8C2B3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdac7Q8C2B3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdac7Q8C2B3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdac7Q8C2B3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdac7Q8C2B3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdac7Q8C2B3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdac7Q8C2B3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdac7Q8C2B3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdac7Q8C2B3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdac7Q8C2B3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdac7Q8C2B3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdac7Q8C2B3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdac7Q8C2B3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdac7Q8C2B3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdac7Q8C2B3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdac7Q8C2B3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdac7Q8C2B3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdac7Q8C2B3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdac7Q8C2B3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac7Q8C2B3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac7Q8C2B3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac7Q8C2B3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac7Q8C2B3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac7Q8C2B3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac7Q8C2B3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac7Q8C2B3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac7Q8C2B3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac7Q8C2B3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac7Q8C2B3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac7Q8C2B3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac7Q8C2B3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac7Q8C2B3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac7Q8C2B3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac7Q8C2B3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac7Q8C2B3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac7Q8C2B3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac7Q8C2B3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac7Q8C2B3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac7Q8C2B3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac7Q8C2B3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac7Q8C2B3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac7Q8C2B3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac7Q8C2B3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac7Q8C2B3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac7Q8C2B3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac7Q8C2B3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac7Q8C2B3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac7Q8C2B3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac7Q8C2B3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac7Q8C2B3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac7Q8C2B3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac7Q8C2B3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac7Q8C2B3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac7Q8C2B3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac7Q8C2B3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac7Q8C2B3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac7Q8C2B3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac7Q8C2B3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac7Q8C2B3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac7Q8C2B3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac7Q8C2B3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac7Q8C2B3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac7Q8C2B3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac7Q8C2B3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac7Q8C2B3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac7Q8C2B3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac7Q8C2B3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac7Q8C2B3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac7Q8C2B3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac7Q8C2B3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac7Q8C2B3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac7Q8C2B3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac7Q8C2B3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac7Q8C2B3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac7Q8C2B3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac7Q8C2B3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac7Q8C2B3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac7Q8C2B3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac7Q8C2B3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac7Q8C2B3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms