Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
FarsaQ8C0C7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FarsaQ8C0C7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms