Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
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Snx16Q8C080 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx16Q8C080 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Snx16Q8C080 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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Snx16Q8C080 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx16Q8C080 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx16Q8C080 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx16Q8C080 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
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Snx16Q8C080 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Snx16Q8C080 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Snx16Q8C080 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx16Q8C080 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx16Q8C080 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx16Q8C080 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Snx16Q8C080 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx16Q8C080 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Snx16Q8C080 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx16Q8C080 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx16Q8C080 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx16Q8C080 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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