Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL7

Arfrp1, ADP-ribosylation factor-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfrp1Q8BXL7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arfrp1Q8BXL7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arfrp1Q8BXL7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arfrp1Q8BXL7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arfrp1Q8BXL7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arfrp1Q8BXL7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Arfrp1Q8BXL7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Arfrp1Q8BXL7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Arfrp1Q8BXL7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Arfrp1Q8BXL7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfrp1Q8BXL7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms