Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXF8

Actrt3, Actin-related protein T3, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt3Q8BXF8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Actrt3Q8BXF8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms