Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn17Q8BXA6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn17Q8BXA6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn17Q8BXA6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn17Q8BXA6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn17Q8BXA6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn17Q8BXA6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn17Q8BXA6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn17Q8BXA6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn17Q8BXA6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn17Q8BXA6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn17Q8BXA6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn17Q8BXA6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Cldn17Q8BXA6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Cldn17Q8BXA6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn17Q8BXA6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms