Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX22

Sall4, Sal-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall4Q8BX22 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sall4Q8BX22 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sall4Q8BX22 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sall4Q8BX22 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sall4Q8BX22 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sall4Q8BX22 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sall4Q8BX22 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sall4Q8BX22 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sall4Q8BX22 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sall4Q8BX22 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sall4Q8BX22 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sall4Q8BX22 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sall4Q8BX22 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sall4Q8BX22 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sall4Q8BX22 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sall4Q8BX22 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms