Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rbbp5Q8BX09 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp5Q8BX09 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms