Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmod1Q8BVA4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms