Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV66

Ifi44, Interferon-induced protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi44Q8BV66 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ifi44Q8BV66 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifi44Q8BV66 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifi44Q8BV66 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifi44Q8BV66 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifi44Q8BV66 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifi44Q8BV66 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifi44Q8BV66 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifi44Q8BV66 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifi44Q8BV66 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifi44Q8BV66 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifi44Q8BV66 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifi44Q8BV66 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifi44Q8BV66 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifi44Q8BV66 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifi44Q8BV66 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifi44Q8BV66 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifi44Q8BV66 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifi44Q8BV66 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms