Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUV6

Lsm11, U7 snRNA-associated Sm-like protein LSm11, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm11Q8BUV6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lsm11Q8BUV6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm11Q8BUV6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm11Q8BUV6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm11Q8BUV6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm11Q8BUV6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms