Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLH7

Hirip3, HIRA-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hirip3Q8BLH7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hirip3Q8BLH7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hirip3Q8BLH7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hirip3Q8BLH7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hirip3Q8BLH7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Hirip3Q8BLH7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hirip3Q8BLH7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hirip3Q8BLH7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hirip3Q8BLH7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hirip3Q8BLH7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hirip3Q8BLH7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hirip3Q8BLH7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hirip3Q8BLH7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hirip3Q8BLH7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hirip3Q8BLH7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hirip3Q8BLH7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hirip3Q8BLH7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hirip3Q8BLH7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hirip3Q8BLH7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hirip3Q8BLH7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hirip3Q8BLH7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hirip3Q8BLH7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hirip3Q8BLH7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Hirip3Q8BLH7 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Hirip3Q8BLH7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hirip3Q8BLH7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hirip3Q8BLH7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hirip3Q8BLH7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hirip3Q8BLH7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hirip3Q8BLH7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hirip3Q8BLH7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hirip3Q8BLH7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hirip3Q8BLH7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hirip3Q8BLH7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hirip3Q8BLH7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hirip3Q8BLH7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hirip3Q8BLH7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hirip3Q8BLH7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hirip3Q8BLH7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Hirip3Q8BLH7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hirip3Q8BLH7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Hirip3Q8BLH7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hirip3Q8BLH7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hirip3Q8BLH7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hirip3Q8BLH7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hirip3Q8BLH7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hirip3Q8BLH7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hirip3Q8BLH7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hirip3Q8BLH7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hirip3Q8BLH7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hirip3Q8BLH7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hirip3Q8BLH7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hirip3Q8BLH7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hirip3Q8BLH7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hirip3Q8BLH7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Hirip3Q8BLH7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hirip3Q8BLH7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Hirip3Q8BLH7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hirip3Q8BLH7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hirip3Q8BLH7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hirip3Q8BLH7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hirip3Q8BLH7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hirip3Q8BLH7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Hirip3Q8BLH7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hirip3Q8BLH7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hirip3Q8BLH7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hirip3Q8BLH7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hirip3Q8BLH7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hirip3Q8BLH7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hirip3Q8BLH7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hirip3Q8BLH7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hirip3Q8BLH7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hirip3Q8BLH7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hirip3Q8BLH7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hirip3Q8BLH7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hirip3Q8BLH7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hirip3Q8BLH7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hirip3Q8BLH7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hirip3Q8BLH7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hirip3Q8BLH7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hirip3Q8BLH7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hirip3Q8BLH7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hirip3Q8BLH7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hirip3Q8BLH7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hirip3Q8BLH7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hirip3Q8BLH7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hirip3Q8BLH7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hirip3Q8BLH7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hirip3Q8BLH7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hirip3Q8BLH7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hirip3Q8BLH7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hirip3Q8BLH7 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hirip3Q8BLH7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hirip3Q8BLH7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hirip3Q8BLH7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hirip3Q8BLH7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hirip3Q8BLH7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hirip3Q8BLH7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hirip3Q8BLH7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hirip3Q8BLH7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms