Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms