Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ83

Tm2d3, TM2 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d3Q8BJ83 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tm2d3Q8BJ83 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tm2d3Q8BJ83 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tm2d3Q8BJ83 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tm2d3Q8BJ83 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tm2d3Q8BJ83 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tm2d3Q8BJ83 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tm2d3Q8BJ83 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tm2d3Q8BJ83 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tm2d3Q8BJ83 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tm2d3Q8BJ83 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tm2d3Q8BJ83 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tm2d3Q8BJ83 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tm2d3Q8BJ83 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tm2d3Q8BJ83 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tm2d3Q8BJ83 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tm2d3Q8BJ83 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm2d3Q8BJ83 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm2d3Q8BJ83 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm2d3Q8BJ83 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm2d3Q8BJ83 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm2d3Q8BJ83 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm2d3Q8BJ83 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tm2d3Q8BJ83 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm2d3Q8BJ83 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tm2d3Q8BJ83 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm2d3Q8BJ83 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm2d3Q8BJ83 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm2d3Q8BJ83 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm2d3Q8BJ83 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm2d3Q8BJ83 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm2d3Q8BJ83 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tm2d3Q8BJ83 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tm2d3Q8BJ83 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tm2d3Q8BJ83 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm2d3Q8BJ83 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tm2d3Q8BJ83 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tm2d3Q8BJ83 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tm2d3Q8BJ83 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tm2d3Q8BJ83 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm2d3Q8BJ83 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm2d3Q8BJ83 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tm2d3Q8BJ83 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm2d3Q8BJ83 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tm2d3Q8BJ83 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tm2d3Q8BJ83 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tm2d3Q8BJ83 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm2d3Q8BJ83 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tm2d3Q8BJ83 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tm2d3Q8BJ83 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tm2d3Q8BJ83 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tm2d3Q8BJ83 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tm2d3Q8BJ83 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tm2d3Q8BJ83 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tm2d3Q8BJ83 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tm2d3Q8BJ83 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tm2d3Q8BJ83 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tm2d3Q8BJ83 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tm2d3Q8BJ83 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tm2d3Q8BJ83 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tm2d3Q8BJ83 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tm2d3Q8BJ83 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tm2d3Q8BJ83 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tm2d3Q8BJ83 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tm2d3Q8BJ83 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tm2d3Q8BJ83 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tm2d3Q8BJ83 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tm2d3Q8BJ83 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tm2d3Q8BJ83 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tm2d3Q8BJ83 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tm2d3Q8BJ83 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tm2d3Q8BJ83 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tm2d3Q8BJ83 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tm2d3Q8BJ83 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tm2d3Q8BJ83 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tm2d3Q8BJ83 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tm2d3Q8BJ83 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tm2d3Q8BJ83 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tm2d3Q8BJ83 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tm2d3Q8BJ83 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tm2d3Q8BJ83 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tm2d3Q8BJ83 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tm2d3Q8BJ83 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tm2d3Q8BJ83 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tm2d3Q8BJ83 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tm2d3Q8BJ83 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tm2d3Q8BJ83 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tm2d3Q8BJ83 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tm2d3Q8BJ83 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tm2d3Q8BJ83 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tm2d3Q8BJ83 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tm2d3Q8BJ83 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tm2d3Q8BJ83 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tm2d3Q8BJ83 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tm2d3Q8BJ83 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tm2d3Q8BJ83 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tm2d3Q8BJ83 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tm2d3Q8BJ83 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tm2d3Q8BJ83 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tm2d3Q8BJ83 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms