Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms