Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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Ubash3bQ8BGG7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubash3bQ8BGG7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms