Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

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Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Htatsf1Q8BGC0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Htatsf1Q8BGC0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms