Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms