Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc50Q810U5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms