Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 399.2 ms