Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms