Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms