Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR7

Clspn, Claspin, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClspnQ80YR7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ClspnQ80YR7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ClspnQ80YR7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ClspnQ80YR7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ClspnQ80YR7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ClspnQ80YR7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ClspnQ80YR7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ClspnQ80YR7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ClspnQ80YR7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ClspnQ80YR7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ClspnQ80YR7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ClspnQ80YR7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ClspnQ80YR7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ClspnQ80YR7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ClspnQ80YR7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ClspnQ80YR7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ClspnQ80YR7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ClspnQ80YR7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ClspnQ80YR7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ClspnQ80YR7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ClspnQ80YR7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ClspnQ80YR7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ClspnQ80YR7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ClspnQ80YR7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ClspnQ80YR7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ClspnQ80YR7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ClspnQ80YR7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ClspnQ80YR7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ClspnQ80YR7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ClspnQ80YR7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ClspnQ80YR7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ClspnQ80YR7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ClspnQ80YR7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ClspnQ80YR7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ClspnQ80YR7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ClspnQ80YR7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ClspnQ80YR7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ClspnQ80YR7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ClspnQ80YR7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ClspnQ80YR7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ClspnQ80YR7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ClspnQ80YR7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ClspnQ80YR7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ClspnQ80YR7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ClspnQ80YR7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ClspnQ80YR7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ClspnQ80YR7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ClspnQ80YR7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ClspnQ80YR7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ClspnQ80YR7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ClspnQ80YR7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ClspnQ80YR7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ClspnQ80YR7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ClspnQ80YR7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ClspnQ80YR7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ClspnQ80YR7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ClspnQ80YR7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ClspnQ80YR7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ClspnQ80YR7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ClspnQ80YR7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ClspnQ80YR7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ClspnQ80YR7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ClspnQ80YR7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ClspnQ80YR7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ClspnQ80YR7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ClspnQ80YR7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ClspnQ80YR7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ClspnQ80YR7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ClspnQ80YR7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ClspnQ80YR7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ClspnQ80YR7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ClspnQ80YR7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ClspnQ80YR7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ClspnQ80YR7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ClspnQ80YR7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ClspnQ80YR7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ClspnQ80YR7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ClspnQ80YR7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ClspnQ80YR7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ClspnQ80YR7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ClspnQ80YR7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ClspnQ80YR7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ClspnQ80YR7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ClspnQ80YR7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ClspnQ80YR7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ClspnQ80YR7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ClspnQ80YR7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ClspnQ80YR7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ClspnQ80YR7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ClspnQ80YR7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ClspnQ80YR7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ClspnQ80YR7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ClspnQ80YR7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ClspnQ80YR7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ClspnQ80YR7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ClspnQ80YR7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ClspnQ80YR7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ClspnQ80YR7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ClspnQ80YR7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ClspnQ80YR7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms