Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp8Q80YR6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp8Q80YR6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp8Q80YR6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp8Q80YR6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp8Q80YR6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp8Q80YR6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp8Q80YR6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp8Q80YR6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp8Q80YR6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp8Q80YR6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp8Q80YR6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp8Q80YR6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp8Q80YR6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp8Q80YR6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp8Q80YR6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp8Q80YR6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp8Q80YR6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp8Q80YR6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp8Q80YR6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp8Q80YR6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp8Q80YR6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp8Q80YR6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp8Q80YR6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp8Q80YR6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp8Q80YR6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp8Q80YR6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp8Q80YR6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp8Q80YR6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp8Q80YR6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp8Q80YR6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp8Q80YR6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp8Q80YR6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp8Q80YR6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms