Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Kdm5bQ80Y84 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Kdm5bQ80Y84 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Kdm5bQ80Y84 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Kdm5bQ80Y84 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Kdm5bQ80Y84 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Kdm5bQ80Y84 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Kdm5bQ80Y84 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Kdm5bQ80Y84 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Kdm5bQ80Y84 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Kdm5bQ80Y84 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Kdm5bQ80Y84 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Kdm5bQ80Y84 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Kdm5bQ80Y84 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kdm5bQ80Y84 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kdm5bQ80Y84 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kdm5bQ80Y84 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kdm5bQ80Y84 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kdm5bQ80Y84 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kdm5bQ80Y84 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Kdm5bQ80Y84 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Kdm5bQ80Y84 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Kdm5bQ80Y84 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Kdm5bQ80Y84 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Kdm5bQ80Y84 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Kdm5bQ80Y84 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Kdm5bQ80Y84 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kdm5bQ80Y84 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Kdm5bQ80Y84 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kdm5bQ80Y84 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kdm5bQ80Y84 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Kdm5bQ80Y84 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kdm5bQ80Y84 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kdm5bQ80Y84 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kdm5bQ80Y84 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kdm5bQ80Y84 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kdm5bQ80Y84 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Kdm5bQ80Y84 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kdm5bQ80Y84 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kdm5bQ80Y84 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Kdm5bQ80Y84 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Kdm5bQ80Y84 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Kdm5bQ80Y84 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Kdm5bQ80Y84 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Kdm5bQ80Y84 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Kdm5bQ80Y84 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Kdm5bQ80Y84 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Kdm5bQ80Y84 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Kdm5bQ80Y84 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms