Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ttc28Q80XJ3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ttc28Q80XJ3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ttc28Q80XJ3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ttc28Q80XJ3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ttc28Q80XJ3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ttc28Q80XJ3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ttc28Q80XJ3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms