Protein–RNA interactions for Protein: Q80XC6

Nrde2, Protein NRDE2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrde2Q80XC6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrde2Q80XC6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms