Protein–RNA interactions for Protein: Q80WM4

Hapln4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hapln4Q80WM4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hapln4Q80WM4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms