Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube3cQ80U95 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ube3cQ80U95 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms