Protein–RNA interactions for Protein: Q80TE0

Rpap1, RNA polymerase II-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap1Q80TE0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rpap1Q80TE0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rpap1Q80TE0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rpap1Q80TE0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rpap1Q80TE0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Rpap1Q80TE0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rpap1Q80TE0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rpap1Q80TE0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rpap1Q80TE0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rpap1Q80TE0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Rpap1Q80TE0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rpap1Q80TE0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rpap1Q80TE0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rpap1Q80TE0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rpap1Q80TE0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rpap1Q80TE0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rpap1Q80TE0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rpap1Q80TE0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rpap1Q80TE0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Rpap1Q80TE0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Rpap1Q80TE0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rpap1Q80TE0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rpap1Q80TE0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rpap1Q80TE0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rpap1Q80TE0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Rpap1Q80TE0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rpap1Q80TE0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rpap1Q80TE0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rpap1Q80TE0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rpap1Q80TE0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rpap1Q80TE0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rpap1Q80TE0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rpap1Q80TE0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rpap1Q80TE0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rpap1Q80TE0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rpap1Q80TE0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rpap1Q80TE0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rpap1Q80TE0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rpap1Q80TE0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rpap1Q80TE0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms