Protein–RNA interactions for Protein: Q80T74

Klhl29, Kelch-like protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl29Q80T74 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms