Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPH6

Mycbp2, E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2, mousemouse

Predictions only

Length 4,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mycbp2Q7TPH6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mycbp2Q7TPH6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms