Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms