Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN88

Pkd1l2, Polycystic kidney disease protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l2Q7TN88 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pkd1l2Q7TN88 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms