Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HhipQ7TN16 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms