Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Shq1Q7TMX5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Shq1Q7TMX5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Shq1Q7TMX5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Shq1Q7TMX5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Shq1Q7TMX5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Shq1Q7TMX5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Shq1Q7TMX5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Shq1Q7TMX5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Shq1Q7TMX5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Shq1Q7TMX5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Shq1Q7TMX5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Shq1Q7TMX5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Shq1Q7TMX5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Shq1Q7TMX5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Shq1Q7TMX5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Shq1Q7TMX5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Shq1Q7TMX5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Shq1Q7TMX5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Shq1Q7TMX5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Shq1Q7TMX5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Shq1Q7TMX5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Shq1Q7TMX5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Shq1Q7TMX5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Shq1Q7TMX5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Shq1Q7TMX5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Shq1Q7TMX5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Shq1Q7TMX5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Shq1Q7TMX5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Shq1Q7TMX5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Shq1Q7TMX5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Shq1Q7TMX5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Shq1Q7TMX5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Shq1Q7TMX5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Shq1Q7TMX5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms