Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms