Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TwistnbQ78WZ7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TwistnbQ78WZ7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TwistnbQ78WZ7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TwistnbQ78WZ7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TwistnbQ78WZ7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TwistnbQ78WZ7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TwistnbQ78WZ7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TwistnbQ78WZ7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TwistnbQ78WZ7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TwistnbQ78WZ7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TwistnbQ78WZ7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TwistnbQ78WZ7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TwistnbQ78WZ7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TwistnbQ78WZ7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TwistnbQ78WZ7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TwistnbQ78WZ7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TwistnbQ78WZ7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TwistnbQ78WZ7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TwistnbQ78WZ7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TwistnbQ78WZ7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TwistnbQ78WZ7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TwistnbQ78WZ7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TwistnbQ78WZ7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TwistnbQ78WZ7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TwistnbQ78WZ7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TwistnbQ78WZ7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TwistnbQ78WZ7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TwistnbQ78WZ7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TwistnbQ78WZ7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TwistnbQ78WZ7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TwistnbQ78WZ7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TwistnbQ78WZ7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TwistnbQ78WZ7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TwistnbQ78WZ7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TwistnbQ78WZ7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TwistnbQ78WZ7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TwistnbQ78WZ7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TwistnbQ78WZ7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TwistnbQ78WZ7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TwistnbQ78WZ7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TwistnbQ78WZ7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TwistnbQ78WZ7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TwistnbQ78WZ7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TwistnbQ78WZ7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TwistnbQ78WZ7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TwistnbQ78WZ7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TwistnbQ78WZ7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TwistnbQ78WZ7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TwistnbQ78WZ7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TwistnbQ78WZ7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms