Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ncapd3Q6ZQK0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ncapd3Q6ZQK0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Ncapd3Q6ZQK0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ncapd3Q6ZQK0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ncapd3Q6ZQK0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ncapd3Q6ZQK0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ncapd3Q6ZQK0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ncapd3Q6ZQK0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ncapd3Q6ZQK0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ncapd3Q6ZQK0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ncapd3Q6ZQK0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ncapd3Q6ZQK0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ncapd3Q6ZQK0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ncapd3Q6ZQK0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ncapd3Q6ZQK0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ncapd3Q6ZQK0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ncapd3Q6ZQK0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ncapd3Q6ZQK0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ncapd3Q6ZQK0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ncapd3Q6ZQK0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ncapd3Q6ZQK0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ncapd3Q6ZQK0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ncapd3Q6ZQK0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Ncapd3Q6ZQK0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ncapd3Q6ZQK0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ncapd3Q6ZQK0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ncapd3Q6ZQK0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ncapd3Q6ZQK0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Ncapd3Q6ZQK0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ncapd3Q6ZQK0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ncapd3Q6ZQK0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms