Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Topbp1Q6ZQF0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms