Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
LcorQ6ZPI3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms