Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc88cQ6VGS5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc88cQ6VGS5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms