Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2P8

Neil2, Endonuclease 8-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil2Q6R2P8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Neil2Q6R2P8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Neil2Q6R2P8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Neil2Q6R2P8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Neil2Q6R2P8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Neil2Q6R2P8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Neil2Q6R2P8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Neil2Q6R2P8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Neil2Q6R2P8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Neil2Q6R2P8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Neil2Q6R2P8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neil2Q6R2P8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neil2Q6R2P8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neil2Q6R2P8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Neil2Q6R2P8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neil2Q6R2P8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neil2Q6R2P8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neil2Q6R2P8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neil2Q6R2P8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neil2Q6R2P8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neil2Q6R2P8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neil2Q6R2P8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neil2Q6R2P8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neil2Q6R2P8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neil2Q6R2P8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neil2Q6R2P8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms