Protein–RNA interactions for Protein: Q6QD59

Bnip1, Vesicle transport protein SEC20, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip1Q6QD59 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bnip1Q6QD59 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bnip1Q6QD59 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bnip1Q6QD59 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bnip1Q6QD59 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bnip1Q6QD59 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bnip1Q6QD59 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Bnip1Q6QD59 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bnip1Q6QD59 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bnip1Q6QD59 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bnip1Q6QD59 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bnip1Q6QD59 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bnip1Q6QD59 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bnip1Q6QD59 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bnip1Q6QD59 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bnip1Q6QD59 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Bnip1Q6QD59 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bnip1Q6QD59 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Bnip1Q6QD59 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Bnip1Q6QD59 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Bnip1Q6QD59 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bnip1Q6QD59 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms