Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHU5

Sort1, Sortilin, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sort1Q6PHU5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Sort1Q6PHU5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sort1Q6PHU5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sort1Q6PHU5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sort1Q6PHU5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sort1Q6PHU5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sort1Q6PHU5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sort1Q6PHU5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sort1Q6PHU5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sort1Q6PHU5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sort1Q6PHU5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sort1Q6PHU5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sort1Q6PHU5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sort1Q6PHU5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sort1Q6PHU5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sort1Q6PHU5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sort1Q6PHU5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sort1Q6PHU5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sort1Q6PHU5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sort1Q6PHU5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sort1Q6PHU5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sort1Q6PHU5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sort1Q6PHU5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sort1Q6PHU5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sort1Q6PHU5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sort1Q6PHU5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms