Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGC7

Slc35e3, Solute carrier family 35 member E3, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc35e3Q6PGC7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms